Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VPS72Q15906 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VPS72Q15906 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms