Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNA6Q15825 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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