Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRRQ15256 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms