Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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