Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL19A1Q14993 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms