Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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CHD4Q14839 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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CHD4Q14839 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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CHD4Q14839 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
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CHD4Q14839 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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CHD4Q14839 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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CHD4Q14839 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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CHD4Q14839 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
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CHD4Q14839 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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