Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GTF2H3Q13889 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF2H3Q13889 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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