Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFAIP1Q13829 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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