Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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TUBB3Q13509 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TUBB3Q13509 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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