Protein–RNA interactions for Protein: Q08826

SNX3, Sorting nexin-3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX3Q08826 RGC1YPR115W 3252 nt2.78□□□□□ -1.96
SNX3Q08826 YCT1YLL055W 1596 nt2.78□□□□□ -1.96
SNX3Q08826 BRE5YNR051C 1548 nt2.78□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RAD5YLR032W 3510 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 MPS1YDL028C 2295 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SLK19YOR195W 2466 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 CHS3YBR023C 3498 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 PBP4YDL053C 558 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 TMA20YER007C-A 546 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RTT105YER104W 627 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YFR054CYFR054C 579 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SFT1YKL006C-A 294 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YKR033CYKR033C 426 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 PDR17YNL264C 1053 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YAP7YOL028C 738 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 TUM1YOR251C 915 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 VBA4YDR119W 2307 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 BPT1YLL015W 4680 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 AXL1YPR122W 3627 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 CIK1YMR198W 1785 nt2.77□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 XRN1YGL173C 4587 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 HBT1YDL223C 3141 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SRO77YBL106C 3033 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YDL163WYDL163W 303 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YDR262WYDR262W 819 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 CPR5YDR304C 678 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SAE2YGL175C 1038 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 MVB12YGR206W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RPL13BYMR142C 600 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 PAI3YMR174C 207 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 ATX1YNL259C 222 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 CUR1YPR158W 759 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 MBA1YBR185C 837 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 TCB2YNL087W 3537 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SEC15YGL233W 2733 nt2.76□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YDR061WYDR061W 1620 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 MUS81YDR386W 1899 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 NSA1YGL111W 1392 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 TIF4631YGR162W 2859 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 ROM1YGR070W 3468 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 PPH3YDR075W 927 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 EMC4YGL231C 573 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SMA2YML066C 1110 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 DYN3YMR299C 939 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YOR277CYOR277C 309 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YPR170CYPR170C 336 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YBR300CYBR300C 498 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 KIN82YCR091W 2163 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 GIS4YML006C 2325 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 MRS2YOR334W 1413 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YBR259WYBR259W 2067 nt2.75□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 UBX3YDL091C 1368 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 NOP12YOL041C 1380 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 ROG1YGL144C 2058 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 EMI1YDR512C 564 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 NTF2YER009W 378 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YGR107WYGR107W 450 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RPS23AYGR118W 438 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 EFG1YGR271C-A 702 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 PCL5YHR071W 690 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YJR087WYJR087W 351 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YNL235CYNL235C 432 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 PFY1YOR122C 381 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RPS23BYPR132W 438 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SET1YHR119W 3243 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 MFB1YDR219C 1398 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YKL075CYKL075C 1353 nt2.74□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 FRE8YLR047C 2061 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YLR446WYLR446W 1302 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 HFM1YGL251C 3564 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 VEL1YGL258W 621 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RPL11BYGR085C 525 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RPL17BYJL177W 555 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RIM9YMR063W 720 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RPL11AYPR102C 525 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 ETP1YHL010C 1758 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 ASI3YNL008C 2031 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 PAM1YDR251W 2493 nt2.73□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 BCK1YJL095W 4437 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 snR5snR5 204 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 RSM24YDR175C 960 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 VMA21YGR105W 234 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YIL082WYIL082W 873 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 ASG7YJL170C 630 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 BUD19YJL188C 309 nt2.72□□□□□ -1.97
SNX3Q08826 YMR254CYMR254C 309 nt2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.9 ms