Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNB2Q08289 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms