Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RUNX1T1Q06455 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms