Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TNP2Q05952 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms