Protein–RNA interactions for Protein: Q04119

PPN1, Endopolyphosphatase, yeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PPN1	Q04119	PBI2	YNL015W	228 nt		3.6	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	ATG3	YNR007C	933 nt		3.6	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	FYV12	YOR183W	390 nt		3.6	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.6	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	FMP25	YLR077W	1752 nt		3.6	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	SRP68	YPL243W	1800 nt		3.6	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	ABP140	YOR239W	1887 nt		3.6	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.6	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	SPT10	YJL127C	1923 nt		3.6	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	YJL132W	YJL132W	2253 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	JEN1	YKL217W	1851 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	MUB1	YMR100W	1863 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	RSM24	YDR175C	960 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	RPS8B	YER102W	603 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	SPT2	YER161C	1002 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	AGA2	YGL032C	264 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	YJL086C	YJL086C	369 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	YKL044W	YKL044W	321 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	TMA19	YKL056C	504 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	YMR052C-A	YMR052C-A	366 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	RHO5	YNL180C	996 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	YPL088W	YPL088W	1029 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	snR41	snR41	95 nt		3.59	□□□□□ -1.83
PPN1	Q04119	UTP15	YMR093W	1542 nt		3.59	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YPS6	YIR039C	1614 nt		3.59	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	AHC2	YCR082W	387 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	FMN1	YDR236C	657 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	FRQ1	YDR373W	573 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	ECM4	YKR076W	1113 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	RPL13B	YMR142C	600 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	LEE1	YPL054W	906 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	SVS1	YPL163C	783 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YPR096C	YPR096C	303 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	AVT5	YBL089W	1380 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.58	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.57	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	TRX3	YCR083W	384 nt		3.57	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YER119C-A	YER119C-A	372 nt		3.57	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YGR073C	YGR073C	372 nt		3.57	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.57	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	SDH3	YKL141W	597 nt		3.57	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YKL156C-A	YKL156C-A	117 nt		3.57	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	RIM13	YMR154C	2184 nt		3.57	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	RAD26	YJR035W	3258 nt		3.57	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	FAS1	YKL182W	6156 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	PEX5	YDR244W	1839 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	CPA2	YJR109C	3357 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	URA2	YJL130C	6645 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YAP3	YHL009C	993 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	NFU1	YKL040C	771 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YKL063C	YKL063C	504 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	AFB1	YLR040C	675 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YMR304C-A	YMR304C-A	351 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YBR062C	YBR062C	543 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YPR050C	YPR050C	414 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	SLA1	YBL007C	3735 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YGL140C	YGL140C	3660 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	FLO10	YKR102W	3510 nt		3.56	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	SCY1	YGL083W	2415 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	IRC2	YDR112W	309 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YDR149C	YDR149C	708 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	PHM6	YDR281C	315 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	CDC26	YFR036W	375 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YGR039W	YGR039W	312 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	CWC24	YLR323C	780 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	RIM9	YMR063W	720 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	PDR17	YNL264C	1053 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YNR021W	YNR021W	1215 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	EXO5	YBR163W	1758 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YNL193W	YNL193W	1677 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	SSE2	YBR169C	2082 nt		3.55	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	TMA108	YIL137C	2841 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YLR177W	YLR177W	1887 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	TAF1	YGR274C	3201 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	GLC3	YEL011W	2115 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	HUR1	YGL168W	333 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	COX2	Q0250	756 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	DAD2	YKR083C	402 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YMR013C-A	YMR013C-A	150 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	APE2	YKL157W	2859 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	RAD4	YER162C	2265 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YPR003C	YPR003C	2265 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	OSH3	YHR073W	2991 nt		3.54	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	MSD1	YPL104W	1977 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	MRPL11	YDL202W	750 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	GET1	YGL020C	708 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	ANB1	YJR047C	474 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YKT6	YKL196C	603 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	IES3	YLR052W	753 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	CTK3	YML112W	891 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	PIS1	YPR113W	663 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	MRPS9	YBR146W	837 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	DSF2	YBR007C	2211 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	MUD2	YKL074C	1584 nt		3.53	□□□□□ -1.84
PPN1	Q04119	IOC2	YLR095C	2439 nt		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.3 ms