Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC25A11Q02978 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms