Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP46P62068 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP46P62068 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP46P62068 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP46P62068 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP46P62068 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP46P62068 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP46P62068 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP46P62068 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP46P62068 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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