Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2NP61088 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms