Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2A2P52657 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2A2P52657 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms