Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPFP49454 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPFP49454 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPFP49454 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPFP49454 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPFP49454 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPFP49454 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPFP49454 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPFP49454 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CENPFP49454 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms