Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCLCP48506 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCLCP48506 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCLCP48506 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCLCP48506 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLCP48506 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLCP48506 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLCP48506 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLCP48506 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCLCP48506 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCLCP48506 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms