Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CAP42336 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CAP42336 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms