Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 YJR037WYJR037W 384 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 FYV7YLR068W 456 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 BER1YLR412W 825 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 ATX1YNL259C 222 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 YNL324WYNL324W 396 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 SRP68YPL243W 1800 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 ARP4YJL081C 1470 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 NOP4YPL043W 2058 nt3.71□□□□□ -1.82
VID28P40547 EMC1YCL045C 2283 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 YGR042WYGR042W 816 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 PHO80YOL001W 882 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 ATX2YOR079C 942 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 LTP1YPR073C 486 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 VAC14YLR386W 2643 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 TGL3YMR313C 1929 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 YPS6YIR039C 1614 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 SWC4YGR002C 1431 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 GAL80YML051W 1308 nt3.7□□□□□ -1.82
VID28P40547 TIF4631YGR162W 2859 nt3.69□□□□□ -1.82
VID28P40547 YDR115WYDR115W 318 nt3.69□□□□□ -1.82
VID28P40547 YGR039WYGR039W 312 nt3.69□□□□□ -1.82
VID28P40547 ACF4YJR083C 930 nt3.69□□□□□ -1.82
VID28P40547 CSE4YKL049C 690 nt3.69□□□□□ -1.82
VID28P40547 RPL16BYNL069C 597 nt3.69□□□□□ -1.82
VID28P40547 MPD2YOL088C 834 nt3.69□□□□□ -1.82
VID28P40547 YRM1YOR172W 2361 nt3.69□□□□□ -1.82
VID28P40547 HRD1YOL013C 1656 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 HBT1YDL223C 3141 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 PUG1YER185W 912 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 MIC19YFR011C 513 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 RPL11BYGR085C 525 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 YHR213WYHR213W 597 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 TDA8YAL064C-A 381 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 YAR062WYAR062W 597 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 RPS16AYMR143W 432 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 TPK2YPL203W 1143 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 RPL11AYPR102C 525 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 YLR177WYLR177W 1887 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 SHS1YDL225W 1656 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 PCI8YIL071C 1335 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt3.68□□□□□ -1.82
VID28P40547 YBR259WYBR259W 2067 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 ARO1YDR127W 4767 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 RRP5YMR229C 5190 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 STI1YOR027W 1770 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 VPS74YDR372C 1038 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 FMP10YER182W 735 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 MVB12YGR206W 306 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 RPL16AYIL133C 600 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 RSA1YPL193W 1146 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 RIM13YMR154C 2184 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 SSE2YBR169C 2082 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 TAF6YGL112C 1551 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 MUB1YMR100W 1863 nt3.67□□□□□ -1.82
VID28P40547 BAR1YIL015W 1764 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 PHR1YOR386W 1698 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 FRQ1YDR373W 573 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 SMT3YDR510W 306 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 VMA8YEL051W 771 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 SMX2YFL017W-A 234 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 VPS51YKR020W 495 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 MRPL44YMR225C 297 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 HHF1YBR009C 312 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 RGL1YPL066W 1440 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 SKO1YNL167C 1944 nt3.66□□□□□ -1.82
VID28P40547 ERB1YMR049C 2424 nt3.65□□□□□ -1.82
VID28P40547 PEX5YDR244W 1839 nt3.65□□□□□ -1.82
VID28P40547 YMR317WYMR317W 3423 nt3.65□□□□□ -1.82
VID28P40547 snR59snR59 78 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 ECO1YFR027W 846 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 RSR1YGR152C 819 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 SYM1YLR251W 594 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 YLR252WYLR252W 306 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 YLR416CYLR416C 399 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 DYN3YMR299C 939 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 CPA2YJR109C 3357 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 SHE4YOR035C 2370 nt3.65□□□□□ -1.83
VID28P40547 CDC40YDR364C 1368 nt3.64□□□□□ -1.83
VID28P40547 ASM4YDL088C 1587 nt3.64□□□□□ -1.83
VID28P40547 YJL132WYJL132W 2253 nt3.64□□□□□ -1.83
VID28P40547 YFR054CYFR054C 579 nt3.64□□□□□ -1.83
VID28P40547 PRM8YGL053W 714 nt3.64□□□□□ -1.83
VID28P40547 YJL086CYJL086C 369 nt3.64□□□□□ -1.83
VID28P40547 RPC37YKR025W 849 nt3.64□□□□□ -1.83
VID28P40547 FLO9YAL063C 3969 nt3.64□□□□□ -1.83
VID28P40547 YDR061WYDR061W 1620 nt3.63□□□□□ -1.83
VID28P40547 MPS1YDL028C 2295 nt3.63□□□□□ -1.83
VID28P40547 NCS2YNL119W 1482 nt3.63□□□□□ -1.83
VID28P40547 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt3.63□□□□□ -1.83
VID28P40547 YHR130CYHR130C 336 nt3.63□□□□□ -1.83
VID28P40547 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.63□□□□□ -1.83
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