Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRCA1P38398 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRCA1P38398 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms