Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL4A5P29400 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL4A5P29400 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms