Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMLP26374 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMLP26374 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMLP26374 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMLP26374 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMLP26374 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMLP26374 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMLP26374 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMLP26374 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMLP26374 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMLP26374 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMLP26374 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMLP26374 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMLP26374 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMLP26374 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMLP26374 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMLP26374 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHMLP26374 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHMLP26374 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHMLP26374 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMLP26374 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMLP26374 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMLP26374 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMLP26374 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHMLP26374 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHMLP26374 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHMLP26374 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms