Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP100P23497 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP100P23497 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SP100P23497 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SP100P23497 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP100P23497 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP100P23497 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP100P23497 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms