Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk1P11440 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk1P11440 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdk1P11440 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms