Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P10404 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P10404 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P10404 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P10404 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P10404 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P10404 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P10404 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P10404 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P10404 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P10404 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P10404 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P10404 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P10404 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P10404 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms