Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEC24AO95486 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC24AO95486 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms