Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ3O43525 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms