Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA3O43365 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms