Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIAH2O43255 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms