Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP2O14595 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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