Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CUX2O14529 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CUX2O14529 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CUX2O14529 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CUX2O14529 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CUX2O14529 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CUX2O14529 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CUX2O14529 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CUX2O14529 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CUX2O14529 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CUX2O14529 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CUX2O14529 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CUX2O14529 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CUX2O14529 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CUX2O14529 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CUX2O14529 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CUX2O14529 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CUX2O14529 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CUX2O14529 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CUX2O14529 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CUX2O14529 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CUX2O14529 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CUX2O14529 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CUX2O14529 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CUX2O14529 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CUX2O14529 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CUX2O14529 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CUX2O14529 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CUX2O14529 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CUX2O14529 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CUX2O14529 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CUX2O14529 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CUX2O14529 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CUX2O14529 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CUX2O14529 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CUX2O14529 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms