Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIP1O00291 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIP1O00291 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIP1O00291 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIP1O00291 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIP1O00291 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIP1O00291 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIP1O00291 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIP1O00291 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HIP1O00291 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HIP1O00291 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIP1O00291 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HIP1O00291 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms