Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930444P10RikD3YUR1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms