Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E1Z4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E1Z4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E1Z4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4E1Z4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4E1Z4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E1Z4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
B4E1Z4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E1Z4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E1Z4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4E1Z4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4E1Z4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4E1Z4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E1Z4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms