Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RGPD3A6NKT7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RGPD3A6NKT7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms