Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MAP1LC3B2A6NCE7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms