Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SLC6A16-201ENST00000335875 2938 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 WFDC10B-201ENST00000330523 630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MIR941-2-201ENST00000401322 72 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MIR941-4-201ENST00000401376 72 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL512353.1-201ENST00000414798 514 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL034428.1-201ENST00000425939 1101 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 LINC01282-201ENST00000431646 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ZNF101P2-201ENST00000439152 1229 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SMIM10L2B-AS1-201ENST00000453528 1027 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 BNC2-207ENST00000471301 745 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MRPS31P4-201ENST00000509685 898 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC008667.1-201ENST00000515296 568 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC105031.2-201ENST00000522123 814 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 COA4-202ENST00000537289 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 IGHV1OR16-4-201ENST00000566350 205 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ZNF506-207ENST00000587461 831 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL161911.2-201ENST00000603920 371 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TRPC5OS-202ENST00000612026 1043 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 LINC00623-202ENST00000614062 830 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL158077.1-201ENST00000616744 174 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MIR941-5-201ENST00000621667 72 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MIR941-3-201ENST00000637366 72 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SPATA31D3-201ENST00000445385 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ELF3-203ENST00000367284 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL133325.3-201ENST00000622757 3674 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL121832.3-201ENST00000616512 3700 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 CARMN-205ENST00000518014 5131 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC005165.1-201ENST00000446840 1870 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SPOCD1-214ENST00000533231 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 PDHA2-201ENST00000295266 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RBM4-206ENST00000483858 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TSPAN2-202ENST00000369516 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 PASD1-201ENST00000370357 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RASGRP1-213ENST00000561180 2707 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ZNF267-201ENST00000300870 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MTO1-205ENST00000415954 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 COPS4-202ENST00000503682 1702 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 CYP4F35P-201ENST00000582957 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TMEM94-202ENST00000375248 4703 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 FCRLA-210ENST00000367959 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 DHFR2-206ENST00000619045 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 STX12-201ENST00000373943 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ADD3-201ENST00000277900 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 DMGDH-201ENST00000255189 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 OR6T1-201ENST00000321252 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 OBP2A-201ENST00000340780 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ANKRD30BL-202ENST00000409867 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC007253.1-201ENST00000425555 889 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 HCG23-205ENST00000426643 610 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 OR6L1P-201ENST00000441446 910 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL161785.1-201ENST00000455981 583 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC022294.1-201ENST00000460993 865 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RN7SL364P-201ENST00000473668 272 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC093789.1-201ENST00000494861 649 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SLC25A5P9-201ENST00000509905 910 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL050327.1-201ENST00000525424 507 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TIMM10-203ENST00000525587 486 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 VPS28-204ENST00000526054 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC005476.2-201ENST00000555771 509 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC066613.2-201ENST00000561007 560 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC027763.1-201ENST00000572223 720 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC139099.1-204ENST00000575205 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TEX101-201ENST00000598265 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 UNGP3-201ENST00000603734 675 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL136084.3-201ENST00000605631 439 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TP53TG1-206ENST00000610086 849 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 HNRNPCL2-202ENST00000621994 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC005609.3-201ENST00000624566 577 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 SMG6-IT1-201ENST00000624930 374 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AL669831.3-201ENST00000634833 906 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC093390.2-202ENST00000638236 976 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AASS-202ENST00000393376 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MCF2-209ENST00000520602 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC138951.1-201ENST00000502532 2685 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 CHEK2-207ENST00000403642 1359 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ZNF766-206ENST00000599581 2065 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 FNBP1L-202ENST00000271234 4212 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 PDCL-201ENST00000259467 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TPD52L3-202ENST00000344545 2296 ntAPPRIS P4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 ZNF184-201ENST00000211936 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 AC005996.1-201ENST00000478788 1586 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 TBC1D7-221ENST00000607658 1649 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LMO3Q8TAP4 POLR3B-201ENST00000228347 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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