Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PapolbQ9WVP6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms