Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms