Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM5BQ9UGL1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KDM5BQ9UGL1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms