Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IFT172Q9UG01 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IFT172Q9UG01 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms