Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms