Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDP1Q9NUW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDP1Q9NUW8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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