Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKDREJQ9NTG1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKDREJQ9NTG1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms