Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNTNAP4Q9C0A0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNTNAP4Q9C0A0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms