Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAGR1Q9BTK6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAGR1Q9BTK6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms