Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTKNQ9BST9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RTKNQ9BST9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms